MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56E

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017488	A	7	7	1016	1022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017488	TATTT	2	10	1041	1050	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017488	TTA	2	6	1062	1067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017488	T	7	7	1072	1078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017488	T	7	7	1106	1112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017488	ACC	2	6	1123	1128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017488	GTG	2	6	1139	1144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017488	A	6	6	1165	1170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017488	TCA	2	6	1183	1188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017488	ATTT	2	8	1238	1245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017488	TGT	2	6	1250	1255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017488	ATTT	2	8	1256	1263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017488	GTTTTG	2	12	1276	1287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017488	T	6	6	1288	1293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017488	T	6	6	1378	1383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017488	AGCGT	2	10	1487	1496	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017488	TGT	2	6	1513	1518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017488	TGAA	2	8	1544	1551	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017488	ATA	2	6	1552	1557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017488	AGCGC	2	10	1558	1567	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017488	GGA	2	6	1583	1588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017488	TTGC	2	8	1642	1649	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017488	A	7	7	1684	1690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017488	AGCGC	2	10	1700	1709	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017488	GGA	2	6	1725	1730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017488	TTGC	2	8	1784	1791	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017488	A	7	7	1826	1832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017488	A	7	7	1845	1851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017488	G	6	6	1853	1858	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017488	TAC	2	6	1882	1887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017488	C	6	6	1890	1895	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_017488	T	6	6	1964	1969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017488	T	6	6	2004	2009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017488	TTG	2	6	2035	2040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017488	ATT	2	6	2078	2083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017488	T	6	6	2093	2098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.